Бокаловидные клетки кишечника (БКК) обнаруживаются во всех отделах кишечника; но их максимальное число в прямой кишке; особенно в криптах толстого кишечника и вырабатывают слизь; которая выступает защитой слизистой от агрессивных факторов ее содержимого.
Присутствие циркулирующих антител к бокаловидным клеткам кишечника ассоциировано с воспалительными заболеваниями кишечника. Антитела к БКК часто обнаруживаются у пациентов с неспецифическим язвенным колитом; редко встречаются при болезни Крона; других органспецифических заболеваниях и очень редко у здоровых лиц.
Также антитела к бокаловидным клеткам могут встречаться при аутоиммунной энтеропатии —состоянии; которое связано со снижением числа бокаловидных клеток; виллезной атрофией и воспалением в тонком кишечнике.